В 2013 году музей попал в Федеральную целевую программу «Культура России (2012-2018 гг.)». Благодаря этому, три экспоната коми-пермяцкого музея отправились на реставрацию к специалистам Всероссийского художественного научно-реставрационного центра им. И.Э. Грабаря в Москве. Один из экспонатов – икона XIX века “Огненное восхождение пророка Ильи на небо” – вернулся в музей в 2014 году.
Музей им. П.И. Субботина-Пермяка ежегодно реставрирует экспонаты, в основном, на базе Пермского краеведческого музея – около десятка экспонатов в год. Сейчас в стадии восстановления находятся документ периода гражданской войны, фотографии старого Кудымкара и Кувы конца 19 – начала 20 века, графическая работа Е.И. Cубботиной.
Силами музея проведены ремонтно-восстановительные работы ретро-автомобиля “ГАЗ-АА”, переданного на постоянное хранение администрацией г. Кудымкара. Своей очереди ждут “ЗИС-5” и “ГАЗ-51”.
